Tracking the Origin of a Rabbit Haemorrhagic Virus 2 Outbreak in a Wild Rabbit Breeding Centre in Portugal; Epidemiological and Genetic Investigation

As key prey, the wild rabbit downsize constitutes a major drawback on the endangered Iberian lynx (Lynx pardinus) re-introduction in the Iberia. Several captive breeding units mostly located in Alentejo, endeavour the wild rabbit repopulation of depleted areas assigned for the lynx re-introduction. Here we report an RHDV2 outbreak that occurred in early 2016 in a wild rabbit captive breeding unit located in Barrancos municipality. The estimated mortality rate between March and April 2016 was approximately 8.67%. Anatomopathologic examination was carried out for 13 victimized rabbits. Molecular characterization was based on the complete vp60 capsid gene. The 13 rabbit carcasses investigated showed typical macroscopic RHD lesions testing positive to RHDV2-RNA. Comparison of the vp60 nucleotide sequences obtained from two specimens with others publically available disclosed similarities below 98.22% with RHDV2 strains originated in the Iberia and Azores and revealed that the two identical strains from Barrancos-2016 contain six unique single synonymous nucleotide polymorphisms. In the phylogenetic analysis performed, the Barrancos-2016 strains clustered apart from other known strains,meaning they may represent new evolutionary RHDV2 lineages. No clear epidemiological link could be traced for this outbreak where the mortalities were lower compared with previous years. Yet, network analysis suggested a possible connection between the missing intermediates from which the strains from Barrancos 2013, 2014 and 2016 have derived. It is therefore possible that RHDV2 has circulated endemically in the region since 2012, with periodic epizootic occurrences. Still, six years after its emergence in wild rabbits, RHDV2 continues to pose difficulties to the establishment of natural wild rabbit populations that are crucial for the self-sustainability of the local ecosystems.

Clínica e cirurgia de animais de companhia

Este relatório foi realizado no âmbito da conclusão do mestrado integrado em medicina veterinária da Universidade de Évora, encontrando-se dividido em duas partes. A primeira é referente à casuística acompanhada ao longo do estágio curricular, decorrido no Hospital Veterinário do Restelo (HVR), com a duração de quatro meses, desde 03 de Agosto de 2015 a 06 de Dezembro de 2016, sob orientação da Doutora Sandra Branco e coorientação do Dr. Diogo Magno, subdiretor clínico do HVR. A segunda parte é constituída por uma monografia subordinada ao tema “Erliquiose Monocítica Canina”, seguida de um caso clínico acompanhado pelo autor no âmbito do referido tema. A erliquiose monocítica canina (EMC) é uma doença infeciosa transmitida por um vetor, o ixodídeo Riphicephalus sanguineus, cujos controlos químicos e ambientais são essenciais para reduzir a prevalência da doença. É causada por uma bactéria intracelular, Ehrlichia canis, que afeta o sistema imunitário dos cães, manifestando diferentes fases de evolução e podendo apresentar formas aguda e crónica da doença. O tratamento de primeira escolha é o uso da antibioterapia com tetraciclinas, dentre as quais a doxiciclina, para além do tratamento de suporte, como a fluidoterapia. O prognóstico é variável, dependendo da precocidade e eficiência da terapêutica instituída; ABSTRACT: The present report, wrote to get the master degree in veterinary medicine area, on Universidade de Évora, is divided up into two distinct parts. On one hand it describes the clinical situations’ roll, assisted through the experimental trainee, that took place on Hospital Veterinário do Restelo (HVR), for a period of four months, specifically since 3 august 2015 until 6 december 2015, and this trainee was led by Doctor Sandra Branco, and also the HVR’s clinical subdirector Dr. Diogo Magno. On other hand the second parts reveals a monograph titled “ehrlichiosis monocytic canine” (EMC), specifying a particular clinical case followed by the author. The EMC an infectious disease transmitted by a tick - Riphicephalus sanguineus – whose chemical controls and even the environmental ones are crucial to reduce the disease’s prevalence. The disease has an intracellular bacteria origin - Ehrlichia canis – responsability for the dog’s immune system infection, and it reveals different evolution phases and present acute or in some cases chronic forms. The treatment’s first step is to use an antibiotic with tetracycline that include doxycycline, and as a fluid’s therapy addition is use to do the supportive treatment. The diagnosis is variable so it depends on precocity evaluation and even on the therapeutics efficiencies.

Clínica e cirurgia de espécies pecuárias

O presente relatório refere-se às atividades desenvolvidas durante o estágio final do Mestrado Integrado em Medicina Veterinária da Universidade de Évora. O trabalho está dividido em duas componentes. A primeira consiste na descrição das atividades desenvolvidas na área da sanidade, profilaxia e clínica médica e cirúrgica de espécies pecuárias. A área da sanidade animal foi, em termos percentuais, aquela que registou uma maior atividade. A segunda componente visa uma revisão bibliográfica da língua azul ou febre catarral ovina, complementada pelo relato e discussão de dois surtos, um numa vacada e outro num rebanho de ovinos. A língua azul é uma doença epizoótica, infeciosa, de etiologia viral, transmitida por insetos do género Culicoides que afeta ruminantes domésticos e silvestres; Abstract: This report refers to the activities developed during the final stage of the Master‘s Degree in Veterinary Medicine of the University of Évora. The work is divided into two components. The first is the description of the activities in the area of sanity, prophylaxis and medicine and surgery in livestock species. The area of sanity was, percentually, the one with most accounted cases. The second component of this work aims to a literature review of bluetongue, complemented with the presentation and discussion of two outbreaks, one in a cattle herd and the other in a sheep herd. Bluetongue is a viral, epizootic and infectious disease transmitted by insects of the genus Culicoides which affects domestic and wild ruminants.

Clínica e cirurgia de espécies pecuárias

O presente relatório, inerente ao estágio curricular do Mestrado Integrado em Medicina Veterinária da Universidade de Évora, tem como objetivo descrever as atividades desenvolvidas durante o estágio na área da clínica e cirurgia de espécies pecuárias. A primeira parte do relatório consiste na descrição do local de estágio e na distribuição casuística das atividades acompanhadas. A segunda parte consiste numa revisão bibliográfica e no desenvolvimento de dois casos clínicos ocorridos em bovinos, relacionados com o tema, “necrobacilose hepática bovina” (NHB). A NHB é uma doença infecciosa de grande impacto económico, principalmente em explorações de bovinos de engorda intensiva. Carateriza-se pela formação de abcessos hepáticos, cujo agente etiológico primário é Fusobacterium necrophorum. É de difícil diagnóstico em vida, raramente demonstra sinais clínicos e o seu tratamento é pouco eficaz. A prevenção baseia-se na adição de antimicrobianos na alimentação, num correto maneio alimentar e eventualmente vacinação; Abstract: Medical and Surgical Pathology of livestock species The present report, inherent of the master in Veterinary Medicine from the University of Évora, aims to describe the activities carried out during the internship in the field of clinic and surgery of livestock species. The first part of the report is the description of the local of internship and the statistical distribution of activities. The second part consists of a literature review and the development of two clinical cases in cattle, related to the theme, “hepatic bovine necrobacillosis "(HBN). The HBN is an infectious disease of great economic impact, especially in feedlot cattle. It is characterized by the formation of liver abscesses, whose primary etiological agent is Fusobacterium necrophorum. It is difficult to diagnose in life, rarely show clinical signs and their treatment is ineffective. Prevention is based on the addition of antimicrobials in food, a correct feed management and eventually vaccination.